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12021在例外與常態間失落的法治原則 — 論臺灣模式防疫的法制問題邱文聰 法官協會雜誌 第22卷,頁128-145
22020身分證數位化的表象與實際:一個歷史與比較法的考察邱文聰 ; 林煜騰; 許慧瑩; 鍾宏彬; 趙若漢月旦法學雜誌 第303期,頁92-119
32020國民身分識別、戶籍管理與身分證的晶片數位化邱文聰 
42020Limits and Prospects of The Right to be Forgotten in TaiwanWen-Tsong Chiou THE RIGHT TO BE FORGOTTEN: A COMPARATIVE STUDY OF THE EMERGENT RIGHT’S EVOLUTION AND APPLICATION IN EUROPE, THE AMERICAS, AND ASIA (Springer)
52019What Roles Can Lay Citizens Play in the Making of Public Knowledge?Wen-Tsong Chiou EAST ASIAN SCIENCE, TECHNOLOGY AND SOCIETY: AN INTERNATIONAL JOURNAL 13(2), 257-277
62019通訊保障及監察法修正草案之檢討(會議實錄)劉靜怡; 林明昕; 李榮耕; 邱文聰 ; 溫祖德月旦法學雜誌 第288期,頁168-190
72018假作真時真亦假——論管制與處罰攙偽假冒食品邱文聰 ; 張永健 2105 行政管制與行政爭訟 (台北市 : 中央研究院法律學研究所出版委員會)
82018初探人工智慧中的個資保護發展趨勢與潛在的反歧視難題邱文聰 人工智慧相關法律議題芻議 (台北市 : 元照出版社)
92018評智財法院 105 年度刑智上易字第 38 號混油案刑事判決:再論攙偽假冒罪之文義與保護法益的解釋問題邱文聰 月旦醫事法報告 24期,頁64-87
102018「資通安全管理法」何去何從?(會議實錄)謝銘洋; 蔡易餘; 余宛如; 劉靜怡; 林明昕; 黃居正; 邱文聰 月旦法學雜誌 第275期,頁156-167
112018被淘空的法律保留與變質的資訊隱私憲法保障─評最高行政法院一○六年度判字第五四號判決與相關個資法條文邱文聰 月旦法學 第272卷,頁32-44
122017最高行政法院一○六年度判字第五四號判決(健保資料庫案)會議記錄邱文聰 ; 林子儀; 張陳弘; 顏厥安; 范姜真媺; 陳鋕雄; 李建良; 吳全峰; 陳昭如月旦法學雜誌 第272期,頁63-84
132017人文社會科學人類研究倫理審查規範手冊邱文聰 ; 黃昭元; 鄭麗珍; 戴華; 林雅萍科技部人文司, 156 p.
142015The Big Data Rush and Its Discontent in TaiwanWen-Tsong Chiou 
152015假作真時真亦假——論管制攙偽假冒食品邱文聰 ; 張永健 
162015人食狗彘食--食品安全管制的資訊落差與改革芻議邱文聰 ; 張永健 
172015Is Science the Only Thing that Matters in Food Regulation? In Search of Possible Ways to Incorporate Legitimate Cultural and Value ConcernsWen-Tsong Chiou 
182015標示、標準與攙偽假冒邱文聰 
192015The Challenge of Privacy and Autonomy in the Era of Big Data BiobankingWen-Tsong Chiou 
202015從迷失的身分重新找尋食品攙偽假冒管制的可能途徑—以食品身分標準為分析焦點邱文聰 政大法學評論 第141期,頁1-49
212014再訪兩岸簽署書面協定的權力分立課題 —以晚近美國法制與理論的發展為比較觀察的起點邱文聰 台灣法學雜誌 第254期,頁97-110
222013畫餅充飢的食品安全風險管控策略 --簡評食品衛生管理法修正邱文聰 台灣法學雜誌 第238期,頁11-17
232013色情vs.猥褻:找尋言論自由理論欠缺的權力分析觀點邱文聰 月旦法學雜誌 第222期,頁235-239
242013核四公投的虛與實—誰會在停建公投案進退失據?徐偉群; 邱文聰 ; 蘇彥圖台灣法學雜誌 第225期,頁92-109
252012勾勒科學與政治統合的正當法律程序邱文聰 
262012如何克服公衛訴訟中因果推論的難題 —法律系統面對風險社會的一個挑戰邱文聰 科技、醫療與社會 第14期,頁227-264
272010第四屆台法前鋒科學論壇規劃委員期中會議報告邱文聰 國科會
282010建置當代人類研究倫理的治理架構:一個反身凝視的契機邱文聰 ; 莊惠凱人文與社會科學簡訊 第12卷第1期,頁33-39
292010台灣人類研究倫理治理架構之推動莊惠凱; 邱文聰 人文與社會科學簡訊 第12卷第1期,頁4-9
302010Finding the Missing Link Between ELSI and STSChiou, Wen-Tsong EAST ASIAN SCIENCE, TECHNOLOGY AND SOCIETY: AN INTERNATIONAL JOURNAL 4(1), 171-174
312010科學研究自由與第三波科學民主化的挑戰:對「知識憲法」與「政治憲法」二分的一個批判考察邱文聰 科技發展與法律規範雙年刊:科學管制、學術研究自由與多元民主價值 第2期,頁61-115
322010科技發展與法律規範雙年刊 :科學管制、學術研究自由與多元民主價值邱文聰 台北
332010危機中的公共科學—挑戰或契機?導讀「科學管制、學術研究自由與多元民主價值」邱文聰 科技發展與法律規範雙年刊:科學管制、學術研究自由與多元民主價值 第2期,頁ix-xxviii
342010美國大學校院內的人類研究保護計畫-赴美加進行研究倫理委員會實地訪問簡介邱文聰 ; 陳東升人文與社科學簡訊 第11卷第2期,頁92-97
352010危機動員背後的法律問題-從H1N1疫苗政策談起-劉靜怡; 邱文聰 臺灣法學 第147期,頁5-8
362010赴美國及加拿大進行研究倫理委員會實地訪問邱文聰 國科會
372009從資訊自決與資訊隱私的概念區分-評「電腦處理個人資料保護法修正草案」的結構性問題邱文聰 月旦法學 第168期,頁172-189
382009Legal Immunity? Wrong Diagnosis, Wrong Prescription: Another Lesson from Enterovirus VaccinesChiou, Wen-Tsong Journal of the Formosan Medical Association 108(3), 177
392009另一種科技與法律的對話:法律理論與實踐中的實證科學應用(II)邱文聰 國科會
402008普羅米修斯之火與個人自主性與及選擇權的極限:生命科學對法學的挑戰邱文聰 人文與社會科學簡訊 第10卷第1期,頁36-41
412008被忽略的(立法)事實—探詢實證科學在規範論證中的可能角色兼評釋字第584號解釋邱文聰 臺大法學論叢 第37卷第2期,頁233-284
422008科技發展與法律規範雙年刊:公衛風險的法律建構邱文聰 台北
432008在法與科學的幽微交界處:導讀「公衛風險的法律建構」邱文聰 科技發展與法律規範雙年刊:公衛風險的法律建構 第1卷,v-xiii
442008從勞工職災補償制度的因果認定談治理理性的典範移轉邱文聰 科技發展與法律規範雙年刊:公衛風險的法律建構 第1卷,頁99-142
452007Equality and Community in Public Deliberation: Genetic Democracy in TaiwanTai, Terence; Chiou, Wen-Tsong Genetic Democracy: Philosophical Perspectives (Netherlands : Springer Publishing)
462007從「人工生殖法」的適用主體談生育自由的雙面性格邱文聰 法令月刊 第58卷第8期,頁146-153
472007探尋做為人體實驗之在地化倫理規範基礎的集體記憶—以樂生院可疑藥物臨床試驗為例邱文聰 中央研究院法律學研究所籌備處
482007後基因體時代人類基因資料庫的倫理與法律管制架構邱文聰 中央研究院人文社會科學研究中心制度與行為專題研究中心
492006另一種科技與法律的對話──法律理論與實踐中的實證科學應用I邱文聰 國科會
502006風險建構、安全期待與公衛法制邱文聰 中研院法律所(本所研究組群)
512005人體試驗試驗與受試者保護單獨立法可行性及其法案內容之研究邱文聰 衛生署
521998從規範違憲無效到效力宣告種類--再論大法官規範違憲審查之效力宣告形式邱文聰 憲政時代 第23卷第4期,頁23-47