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12021言說天主：明清之際天主教脈絡中的邏輯與類比思維祝平一 
22021作者、編者、剽竊者：從《晰微補化全書》看醫書的抄輯與作者身分祝平一 中央研究院歷史語言研究所集刊 第九十二本第三分，頁561-602
32021台灣演疫：政治、科學與運氣祝平一 「歷史學柑仔店」網站
42020戰後台灣漁業資源之接收（1945-1950）祝平一 「歷史學柑仔店」網站
52020正教與異端：明、清時期「大秦景教流行中國碑」的注疏研究祝平一 中央研究院歷史語言研究所集刊 第91本第2分，頁187-226
62020Needham in Taiwan: Translating Science and Civilisation in China as Politics of Modernity and IdentityPing-yi Chu EASTS 14(2), 379-392
72020「表面工夫」：三教先天仙拼仙祝平一 「歷史學柑仔店」網站
82020Philological Arguments as Religious Suasion: Liu Ning and His Study of Chinese CharactersPing-yi Chu Powerful Arguments: Standards of Validity in Late Imperial China (Leiden : Brill)
92020テキストの鏡影——抜粋本と清初の暦算学祝平一 医学•科学•博物　東アジア古典籍の世界 (東京 : 勉誠出版社)
102019Western Learning, Examinations, and Neo-Confucianism: A Study of Astronomy in Ying Huiqian’s Xingli dazhong (性理大中)Ping-yi Chu East-West Encounter in the Science of Heaven and Earth (天と地の科学 : 東と西の出会い) (Kyoto, Japan : Institute for Research in Humanities, Kyoto University)
112018汪紱和他爹：孝是戀父情結下的斯德哥爾摩症候群？祝平一 「歷史學柑仔店」網站
122018A Mirror to the Calendar: Cut, Paste and Spread the European Calendrical LearningPing-yi Chu History of Mathematical Sciences: Portugal and East Asia V: Visual and Textual Representations in Exchanges Between Europe and East Asia 16th – 18th Centuries (Singapore : World Scientific)
132018Sage: An Unreadable SignPing-yi Chu Reading the Signs: Philology, History, Prognostication. Festschrift for Michael Lackner (Munich : Iudicium)
142017Western Learning, Examinations, and Neo-Confucianism: A Study of Astronomical Sections in Ying Huiqian’s Xingli dazhong (性理大中)Ping-Yi Chu 
152017從認命到造命：袁黃家族的醫學與命理學祝平一 「歷史學柑仔店」網站
162016文本的鏡影：文抄與清初的曆算學祝平一 
172016浮生掠影：胡春田醫師的《杏林承露圖》祝平一 「歷史學柑仔店」網站
182016文本的射影：文抄與西方曆算學的傳佈祝平一 
192016Trigonometric Tables and the Late Ming Calendric Reform: A Case Study of Material Culture in SciencePing-Yi Chu 
202016方寸之間－天主教與清代的心、腦之爭祝平一 漢學研究 第34卷第3期，頁119-160
212015方寸之間：天主教與清代的心、腦之爭祝平一 
222015崔漢綺が見た、漢譯された西洋醫學書祝平一 
232015清末中國の宣教師の西洋藥物學書籍についての思想史考察祝平一 
242015為什麼101與104的高中中國史課綱是一場教育災難？祝平一 「歷史學柑仔店」網站
252015Needham in Taiwan: An Unexpected Turn to STSPing-I Chu 
262015疫病、文本與社會：清代痧症的建構祝平一 中國史新論．醫療史分冊 (臺北 : 中央研究院、聯經出版事業公司)
272015Jiang Yong Reconsidered: On the Relation between Evidential Study and the Tao LearningPing-I Chu 
282015農曆：文化混種祝平一 「歷史學柑仔店」網站
292015Ferdinand Verbiest’s (1623-1688) Criticisms of Chinese Mantic ArtsPing-Yi Chu ; Marie-Neige Cordonnier trans.Pour la Science 449
302015Numerology and Calendrical Learing: The Stories of Yang Guangxian and Liu XiangkuiPing-Yi Chu The Korean Journal for the History of Science 37.2: 479-497
312014Family Instructions of Chinese Physicians: A Preliminary InvestigationPing-Yi Chu 
322014到底誰學誰呀？閒聊清初的「西學中源說」祝平一 中央研究院週報 第1480期，知識天地
332014318：以創意替代暴力的革命祝平一 「歷史學柑仔店」網站
342013第四屆國際漢學會議論文集-衛生與醫療祝平一主編 台北市
352013官君異位：傳教士、朱芳旦與明清之際的心腦之爭祝平一 
362013導讀(與祝平一合著)劉士永 ; 祝平一 健康與社會：華人衛生新史 (台北 : 聯經出版社)
372013瘟疫與社會：以清代的痧症為例祝平一 健康與社會：華人衛生新史 (台北 : 聯經出版事業公司)
382013健康與社會：華人衛生新史祝平一 台北市
392013Review of Florence C. Hsia, Sojourners in a Strange Land: Jesuits and Their Scientific Missions in Late Imperial China (Chicago: University of Chicago Press, 2009, xv+273 pp. $45. ISBN: 9780226355597)Chu, Ping-Yi Annals of Science 70(4), 562-564
402012Reconceptualizing the Mental Organ in China before the Nineteenth CenturyChu, Ping-Yi 
412012Text and Skill: The Case of “Scratching Sha” in the Qing Period祝平一 
422012劉凝與劉壎：考證學與天學關係新探祝平一 新史學 第23卷第1期，頁57-104
432012Review of "Dagmar Schäfer, The Crafting of the 10,000 Things: Knowledge and Technology in Seventeenth-Century China (344 pp., illus., bibli., index. Chicago, IL: University of Chicago Press, 2011)"Chu, Ping-Yi Isis 103(2), 407-408
442012Review of “History of Mathematical Sciences: Portugal and East Asia III: The Jesuits, the Padroado and East Asian Science (1552-1773), edited by Luis Saraiva and Catherine Jami, Singapore; Hackensack, NJ: World Scientific, 2008,”Chu, Ping-Yi EASTM,forthcoming
452011Practicing Heavenly Learning as a Form of Life: The Case of Li NingChu, Ping-Yi 
462011Fortuna at the Crossroad: When Christianity Met Chinese Mantic PracticesChu, Ping-Yi 
472011Adoption and Resistance: Zhang Yongjing [張雍敬] and Ancient Chinese Calendrical MethodsChu, Ping-Yi Science between Europe and Asia: Historical Studies on the Transmission, Adoption and Adaptation of Knowledge (Dordrecht, Heidelberg, New York : Springer)
482011中法殿軍張雍敬祝平一 自然科學史研究 第30卷第4期，頁409-416
492010圖像與分類祝平一 
502010徘徊在《新史學》邊緣：臺灣的科技史研究祝平一 漢學研究通訊 第29卷第3期，頁1-7
512010君官異位：傳教士、朱方旦與十七、八世紀的心腦之爭祝平一 
522010Scientific Texts in Contest, 1600-1800Chu, Ping-Yi Looking at it from Asia: the Processes that Shaped the Sources of History of Science (Boston Studies in the Philosophy of Science) (Netherlands : Springer)
532010藥醫不死病，佛度有緣人：明、清的醫療市場、醫學知識與醫病關係祝平一 中央研究院近代史研究所集刊 第68期，頁1-50
542010中國史新論．科技與中國社會分冊祝平一 台北市
552010Larissa N. Heinrich. The Afterlife of Images: Translating the Pathological Body between China and the West (Duham and London, Duke University Press, 2008, Pp. 222 (Paperback)Chu, Ping-Yi EASTS 4(2), 355-357
562009中國科技史研究的省思祝平一 
572009Textualizing Skill: “Scratching” and Blood-letting in the Treatment of Sha in the Qing PeriodChu, Ping-Yi 
582009Constructing Disease and Narrating the PainChu, Ping-Yi 
592009首爾大學奎章閣藏《崇禎曆書》及其相關史料研究祝平一 奎章閣 第34期，頁250-262（中文）、231-249（韓譯）
602008痧之為疾：中醫知識建構疾病的個案研究祝平一 
612008《崇禎曆書》考祝平一 明代研究 第11期，頁133-161
622008巴別塔之磚：讀Liam Brockey, Journey to the East: The Jesuit Mission to China, 1579-1724 (Cambridge, Massachusetts: The Belknap Press of Harvard University Press, 2007) 隨想祝平一 中央研究院近代史研究所集刊 第62期，頁191-196
632008Brain Anatomical Knowledge in 18th Century ChinaChu, Ping-Yi 
642008有誣必辯：傳教士與朱方旦祝平一 
652008Scientific Texts in Contest, 1600-1800祝平一 
662008馬若瑟的中文文獻與符象論（Figurism）祝平一 
672008日常生活的崩解：毒奶、風險與信任祝平一 科技、醫療與社會 第7期，頁9-12
682008展示科學祝平一 科技、醫療與社會 第7期，頁19-22
692008Anjing Qu, Science and Technology Awards in Modern China (Zhongguo jin xian dai ke ji jiang li zhi du) (Zhongguo jin xian dai ke xue ji shu shi yan jiu cong shu, 329 pp., tables, bibl., index. Jinan: Shandong Education Press [Shandong jiao yu chu ban she], 2005Chu, Ping-Yi Isis 99(2), 444-445
702007《崇禎曆書》的生命史與中西曆算之爭祝平一 
712007Problems with the Brain: European Anatomical Knowledge in Seventeenth-century ChinaChu, Ping-Yi 
722007經傳眾說──馬若瑟的中國經學史Chu, Ping-Yi 中央研究院歷史語言研究所集刊 第78本第3分，頁435-472
732007Archiving Knowledge : A Life History of the Calendrical Treatises of the Chongzhen Reign (Chongzhen lishu)Chu, Ping-Yi Extrême-Orient, Extrême-Occident (H-S), 159-184
742006天學與歷史意識的變遷——王宏翰的《古今醫史》祝平一 中央研究院歷史語言研究所集刊 第77本第4分，頁591-626
752006Taming the Western  Sciences: Compiling Books and Writing Histories, 1600-1800Chu, Ping-Yi 
762006宋、明之際的醫史與「儒醫」祝平一 中央研究院歷史語言研究所集刊 第77本第3分，頁401-449
772006讀：黃一農《兩頭蛇：明末清初的第一代天主教徒》（新竹：清華大學，2005）祝平一 新史學 第17卷第2期，頁251-255
782006Christianity, Natural Philosophy and History of Chinese Medicine: Wang Honghan and His GujinyishiChu, Ping-Yi 
792005明、清之際江南地區的醫病關係祝平一 
802005評介 Fa-ti Fan, British Naturalists in Qing China: Science, Empire and Cultural Encounter (Cambridge: Harvard University Press, 2004)祝平一 新史學 第16卷第3期，頁181-186
812005伏讀聖裁：《曆學疑問補》與〈三角形推算法論〉祝平一 新史學 第16卷第1期，頁51-84
822004金石盟——〈御製天主堂碑記〉與清初的天主教祝平一 中央研究院歷史語言研究所集刊 第75本第2分，頁389-421
832003說地：中國人認識大地形狀的故事祝平一 台北
842003反西法：《定曆玉衡》初探祝平一 相遇與對話：明末清初中西文化交流國際學術研討會論文集 (北京 : 宗教文化出版社)
852003Remembering Our Grand Tradition: Chourenzhuan and the Scientific Exchanges between China and Europe, 1600-1800Chu, Ping-Yi History of Science 41(2), 193-215
862002西曆東漸：晚明中西曆法的初步接觸與曆法形式的衝突祝平一 法國漢學6, 336-344
872002簡介Albert Chan, S.J., Chinese Books and Documents in the Jesuit Archives in Rome: A Descriptive Catalogue (New York & London: M. E. Sharpe, 2002)祝平一 中國文哲研究集刊 第21期，頁455-457
882001碎鏡零史：戰後台業史研究回顧祝平一 新史學 第12卷第2期，頁195-231
892001塑身美容、廣告與台灣九○年代的身體文化祝平一 文化與權力──台灣新文化史 (台北 : 麥田出版社)
902001Review of Science in Ancient China: Researches and Reflections and Medicine, Philosophy and Religion in Ancient China: Researches and Reflections. By Nathan SivinChu, Ping-Yi Journal of Asia Studies 60(2), 538-540
912001Le Prime Reazioni All'astronomia OccidentaleChu, Ping-Yi Storia della Scienza (Rome : Institvto della Enciclopedia Italiana)
922001Science and Medicine in Confucian China, 1600-1800Chu, Ping-Yi Cambridge Chinese History, Ch'ing Dynasty II9(2)
932000「琉球」：一個不「小」的漁村祝平一 古今論衡 第5期，頁104-111
942000評介：韓琦，《中國科學技術的西傳及其影響》（石家莊：河北人民出版社，1999）祝平一 漢學研究 第18卷第2期，頁427-431
951999三角函數表與明末的中西曆法之爭─科學的物質文化試探（下）祝平一 大陸雜誌 第99卷第6期，頁9-18
961999Shigehisa Kuriyama（栗山茂久）, The Expressiveness of the Body and the Divergence of Greek and Chinese Medicine讀後祝平一 新史學 第10卷第4期，頁145-158
971999三角函數表與明末的中西曆法之爭─科學的物質文化試探（上）祝平一 大陸雜誌 第99卷第5期，頁41-48
981999貫通天學、醫學與儒學：王宏翰與明清之際中西醫學的交會祝平一 中央研究院歷史語言研究所集刊 第70本第1分，頁165-201
991999說「猛男」祝平一 婦女與兩性研究通訊 第53期，頁7-8
1001999展望台灣的科技與醫療史研究：一個當代台灣知識社群的分析祝平一 臺灣史研究所 第4卷第2期，頁157-174
1011999Trust, Instruments, and Cross-Cultural Scientific Exchanges: Chinese Debate over the Shape of the Earth, 1600-1800Chu, Ping-Yi Science in Context 12(3), 385-411
1021999Western Astronomy and Evidential Study: Tai Chen on AstronomyChu, Ping-Yi Current Perspectives in the History of Science in East Asia (Seoul : Seoul National University Press)
1031998跨文化知識傳播的個案研究——明末清初關於地圓說的爭議，1600-1800祝平一 中央研究院歷史語言研究所集刊 第69本第3分，頁589-670
1041998臺灣漁業史資料選編：統計篇（一）‧明治─大正祝平一 ; 鄭麗玲; 許全義台北市
1051997Scientific Dispute in the Imperial Court: The 1664 Calendar CaseChu, Ping-Yi Chinese Science 14, 7-34
1061996評介Thomas Laqueur, Making Sex祝平一 新史學 第7卷第4期，頁223-231
1071996身體、靈魂與天主--明末清初西學中的人體生理知識祝平一 新史學 第7卷第2期，頁47-98
1081996實驗室中的隱形人：十七世紀英國的實驗助理祝平一 歷史月刊 第105期，頁166-119
1091996徐家匯藏書樓明清天主教文獻鐘鳴旦; 杜鼎克; 黃一農; 祝平一 台北市
1101996雕給我一個身體：塑身美容廣告中的女性／主體祝平一 婦女與兩性研究通訊 第38期，頁9-17
1111995Ch'eng-Chu Orthodoxy, Evidential Studies and Correlative Cosmology: Chiang Yung and Western AstronomyChu, Ping-Yi Philosophy and the history of science : a Taiwanese journal 4(2), 71-108
1121995簡介Morris J. Vogel, The Invention of the Modern Hospital, Boston 1870-1903祝平一 新史學 第6卷第2期，頁223-230
1131994美國女性史研究動向簡介祝平一 近代中國婦女史研究 第2期，頁291-295
1141994Technical Knowledge, Cultural Practices and Social Boundaries: Wan-nan Scholars and the Recasting of Jesuit Astronomy, 1600-1800Chu, Ping-Yi UCLA, Department of History, p.
1151990漢代的相人術祝平一 台北市
1161989從「肇論」、「壇經」論大乘空宗／禪宗的神秘主義：兼評道默林對大乘／禪宗神秘主義的構想祝平一 鵝湖月刊 第166期，頁30-36
1171989漢代相法略說祝平一 歷史月刊 第15期，頁30-31