| Issue Date | Title | Author(s) | Relation | scopus | WOS | Fulltext/Archive link |
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| 2006 | 02.知識饗宴「南海秘密花園」 | 鄭明修 | ||||
| 2007 | 03.知識饗宴系列03電子書 | 廖弘源; 鄭錦全; 許聞廉; 范毅軍; 張亞中; 陶雨臺; 陳仲瑄; 楊寧蓀; 江博明; 鄭明修; 王明珂 ; 湯德宗 | ||||
| 1995 | 一窺龍宮堂奧－潛訪東北角海岸生物 | 鄭明修 | 大自然 49, 60-66 | |||
| 2014 | 南海保育對東北亞海洋生物多樣性的影響 | 鄭明修 | ||||
| 2009 | 口腹之慾 VS 海洋生態 | 鄭明修 | 大自然, 第104期，頁12-17 | |||
| 1987 | 台灣南灣海域尖枝列孔珊瑚 Seriatopora hystrix 共棲的槍蝦 | 鄭明修; 張崑雄 | 海洋科學研討會，論文摘要集 | |||
| 2005 | 台灣周邊海域大陸棚與大陸斜坡上部砂泥底巨大底棲生物之群聚 | 葉信明; 邵廣昭; 何瓊紋; 盧重成; 莊世昌; 陳天任; 林昕佑; 鄭明修 | ||||
| 2015 | 台灣常見經濟性水產動植物圖鑑 | 邵廣昭; 張睿昇; 鄭明修; 子萱; 邱郁文; 何瓊玟; 陳天任; 何平合; 趙世民; 莊守正; 林沛立 | 台北 | |||
| 1999 | 台灣東北角海兔的分類與族群生態研究 | 林昕佑; 鄭明修 | 台灣水產學會學術論文發表會，論文摘要集 | |||
| 2003 | 台灣河川生態工法下之水生動物多樣性現況 | 鄭明修 | 應用生態工法保育生物多樣性研討會論文集中華民國溪流環境協會 | |||
| 2004 | 台灣海岸生態環境的危機與轉機 | 鄭明修 | 邁向美麗的自然海岸—漁港與海岸保護方法論壇 13-17 | |||
| 1989 | 台灣潛水運動現況調查分析之研究 | 張崑雄; 蘇焉; 夏復國; 鄭明修 | 國家公園學報 第1卷第1期，頁33-49 | |||
| 1997 | 台灣珊瑚礁海域產經濟性無脊椎動物資源的利用與保育 | 鄭明修 | 台灣省水產學會，論文摘要集 | |||
| 2003 | 台灣綠島海洋生態保育與觀光永續發展策略 | 鄭明修 | 台琉論壇，第4回，日本沖繩 31-48 | |||
| 2017 | 國境之南－太平島爭議與南海生態保育 | 鄭明修 | 科學月刊 第570期，頁466-469 | |||
| 2012 | 埃及紅海水晶宮探秘 | 鄭明修 | 大自然, 117,6-15 | |||
| 1989 | 墾丁國家公園小灣海域潛水育樂之規劃 | 張崑雄; 鄭明修; 蘇焉; 邵廣昭; 方力行 | 國家公園學報 第1卷第1期，頁51-85 | |||
| 1996 | 墾丁國家公園海域及陸域甲殼十足類生物相調查 | 游祥平; 鄭明修; 何平合; 陳天任; 施至昀 | 內政部營建署墾丁國家公園管理處，保育研究報告 95, 79 | |||
| 1990 | 墾丁國家公園海域尖枝列孔珊瑚及其共棲甲殼類之生態研究 | 張崑雄; 鄭明修 | 內政部營建署墾丁國家公園管理處保育研究報告 72, 44 | |||
| 1988 | 墾丁國家公園海域軟珊瑚類的研究 | 張崑雄; 戴昌鳳; 鄭明修 | 內政部營建署墾丁國家公園管理處保育研究報告 53, 59 |
