| Issue Date | Title | Author(s) | Relation | scopus | WOS | Fulltext/Archive link |
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| 2007 | 人為活動對墾丁國家公園海域生態衝擊之長期監測研究 | 孟培傑; 鍾國南; 陳正平; 陳明輝; 劉銘欽; 張揚祺; 樊同雲; 林幸助; 劉弼仁; 張家銘; 方力行; 邵廣昭 | 國家公園學報 第17卷第2期，頁89-111 | |||
| 2004 | 人為活動對墾丁國家公園海域生態衝擊之長期監測研究及生態與環境資料庫建立 | 孟培傑; 陳正平; 鍾國南; 劉銘欽; 樊同雲; 張家銘; 田文敏; 張揚祺; 林幸助; 方力行; 邵廣昭 | 國家公園學報 第14卷第2期，頁43-69 | |||
| 2008 | 克氏小丑魚(Amphiprion clarkii)之族群遺傳研究 | 黃建華; 陳正平; 詹榮桂; 戴昌鳳 | ||||
| 1994 | 南沙太平島海域珊瑚礁魚類 | 陳正平; 詹榮桂; 邵廣昭 | 行政院南海政策綱領南海生態環境調查研究報告書 (屏東 : 行政院農業委員會委託國立海洋生物博物館籌備處執行) | |||
| 2011 | 南海東沙島及太平島魚類種類组成和動物地理學特點 | 邵廣昭; 陳正平; 陳静怡; 黄建華; 郭人維 | Biodiversity Science(生物多样性) 19(6), 737-763 | |||
| 2007 | 台灣地區克氏小丑魚與其黑色型族群遺傳研究 | 黃建華; 陳正平; 詹榮桂; 戴昌鳳 | ||||
| 2006 | 台灣所採獲世界新種魚類及年表 | 邵廣昭; 何宣慶; 陳義雄; 陳正平; 沈世傑 | ||||
| 2018 | 台灣氣候模擬系統-探索氣候的前世今生與來世 | 許晃雄 ; 李威良; 許乾忠 ; 蔡宜君 ; 杜佳穎 ; 王懌琪; 陳正平 | 科技部自然科學及永續研究發展處 自然科學簡訊 第三十卷第一期，頁18-23 | |||
| 2011 | 墾丁南灣海域魚類群聚結構之研究及後壁湖海洋資源保護區之成效 | 陳正平; 詹榮桂; 郭人維; 黃建華 | 國家公園學報 第21卷第4期，頁42-51 | |||
| 2007 | 墾丁國家公園海域生態之長期監測研究 | 孟培傑; 鍾國南; 陳正平; 陳明輝; 劉銘欽; 張揚祺; 樊同雲; 林幸助; 劉弼仁; 張家銘; 方力行; 邵廣昭 | 國家公園學報 第17卷第2期，頁71-88 | |||
| 2011 | 墾丁國家公園海域魚類圖鑑 (增修正版) | 陳正平; 邵廣昭; 詹榮桂; 郭人維; 陳靜怡 | 台灣 | |||
| 2010 | 墾丁國家公園海域魚類圖鑑（增修壹版） | 陳正平; 邵廣昭; 詹榮桂; 陳靜怡; 陳靜怡; 郭人維 | 恆春 | |||
| 1992 | 墾丁海域魚類圖鑑 | 邵廣昭; 陳正平; 沈世傑 | 墾丁國家公園管理處 | |||
| 2003 | 大鵬灣潟湖魚類群聚之時空變化 | 陳靜怡; 陳正平; 邵廣昭 | 環境保護 第26卷第1期，頁71-95 | |||
| 1994 | 太平島海域珊瑚礁魚類，行政院南海政策綱領－南海生態環境調查研究報告書 | 陳正平; 詹榮桂; 邵廣昭 | ||||
| 2015 | 建立台灣氣候變遷模擬能力與能量－氣候變遷研究聯盟 | 許晃雄 ; 陳正平; 林沛練; 陳正達 | 自然科學簡訊 第二十七卷第一期，頁36-40 | |||
| 2009 | 後壁湖海洋資源保護區資源調查期中報告 | 詹榮桂; 陳正平 | 台北 | |||
| 2009 | 後壁湖海洋資源保護區資源調查期末報告 | 詹榮桂; 陳正平 | 台北 | |||
| 2010 | 後壁湖海洋資源保護示範區生態資源調查（第二年） (期中報告) | 詹榮桂; 陳正平 | 台北 | |||
| 2010 | 後壁湖海洋資源保護示範區生態資源調查（第二年）(期末報告) | 詹榮桂; 陳正平 | 台北 |
