| Issue Date | Title | Author(s) | Relation | scopus | WOS | Fulltext/Archive link |
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| 2005 | 台灣周邊海域大陸棚與大陸斜坡上部砂泥底巨大底棲生物之群聚 | 葉信明; 邵廣昭; 何瓊紋; 盧重成; 莊世昌; 陳天任; 林昕佑; 鄭明修 | ||||
| 1999 | 台灣東北角海兔的分類與族群生態研究 | 林昕佑; 鄭明修 | 台灣水產學會學術論文發表會，論文摘要集 | |||
| 2011 | 海洋臺灣 : 親海.知海.護海 : 生態保育特輯 | 鄭明修; 黃淑芳; 林昕佑 | 台灣 | |||
| 1999 | 淡水口生態監測系統的建立<第一年>無脊椎動物甲殼類 | 鄭明修; 陳登松; 林昕佑; 程鳳娟 | 中央研究院 176-194 | |||
| 2001 | 淡水河口蝦蟹類群聚變動之研究 | 鄭明修; 林昕佑; 陳登松 | 第二屆河口、潟湖生態與環境研討會，論文摘要集 | |||
| 2010 | 澎湖南方四島海洋生物多樣性保育及永續發展 | 鄭明修; 塗子萱; 林昕佑 | ||||
| 2009 | 澎湖海域寒災對海洋生態衝擊與未來因應策略 | 鄭明修; 林昕佑; 塗子萱; 郭道仁; 陳登松 |
