| Issue Date | Title | Author(s) | Relation | scopus | WOS | Fulltext/Archive link |
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| 2000 | 中央研究院研究報告 | 吳俊宗; 張世杰 | ||||
| 2005 | 以生態工法淨化水庫水質控制優養化研究計畫 | 郭振泰; 吳俊宗; 吳先琪 | 行政院環境保護署EPA-94-U1G1-02-102,265 | |||
| 2006 | 以生態工法淨化水庫水質控制優養化研究計畫(2)-以生物鏈方式淨化水庫水質 | 吳俊宗; 陳弘成; 郭振泰; 吳先琪 | 行政院環境保護署EPA-95-U1G1-02-102,327 | |||
| 2008 | 以生物鏈方式淨化水庫水質實證研究計畫 | 吳俊宗; 陳弘成; 吳先琪; 朱達仁 | 行政院環境保護署EPA-97-U1G1-02-102,153 | |||
| 1999 | 利用生態法則改善水塘水質以提升社區灌溉功能 | 周美惠; 吳俊宗 | 財團法人新環境基金會,61頁 | |||
| 2000 | 台灣淡水藻類的多樣性問題－從矽藻指標看問題 | 吳俊宗 | 2000年海峽兩岸生物多樣性與保育研討會論文集。國立自然科學博物館 | |||
| 2002 | 地震崩塌地之生態研究：Chi-Chi earthquake-caused landslide: grey relational analysis of physico-chemical variables and water body reflectance of a landslide-dammed lake monitored by SPOT satellite. | 吳俊宗; 陳秀如; 陳建璋; 彭嵐霖; 楊智旭; 楊棋明 | 中央研究院九二一災後重建相關研究計劃執行報告書,92-107 | |||
| 1999 | 基隆河指標生物調查方法 | 吳俊宗; 周晉文 | EPA-034880124,2-1~2-21 | |||
| 2002 | 底棲無脊椎動物群聚 | 邵廣昭; 李信徹; 馬堪津; 陳章波; 詹榮桂; 劉小如; 鄭明修; 謝蕙蓮; 吳俊宗; 邱志郁 | 淡水河河口生態監測系統的建立（第三年）,298 | |||
| 2010 | 新山水庫藻類優養指標與水庫水質相關性之研究 | 吳先琪; 吳俊宗 | 新山水庫藻類優養指標與水庫水質相關性之研究,156 | |||
| 2011 | 新山水庫藻類優養指標與水庫水質相關性之研究 | 吳先琪; 吳俊宗 | 新山水庫藻類優養指標與水庫水質相關性之研究,255 | |||
| 2011 | 水庫水質優養化相關參數合理性研究 | 吳俊宗 | 水庫水質優養化相關參數合理性研究(2),54 | |||
| 2009 | 水庫水質優養化相關參數合理性研究 | 吳俊宗; 吳先琪 | 研究報告,206 | |||
| 2010 | 水庫水質優養化相關參數合理性研究 | 吳俊宗 | 水庫水質優養化相關參數合理性研究,54 | |||
| 1998 | 流域水資源與生態變遷之調查分析計畫—以後龍溪為案例 | 周昌弘; 洪楚璋; 吳俊宗; 邵廣昭 | 87EC2B370028,168 pp | |||
| 1999 | 流域水資源與生態變遷之調查分析計畫—以後龍溪為案例 (1/3~3/3) | 周昌弘; 洪楚璋; 吳俊宗; 邵廣昭 | 88EC2B370024,277 pp | |||
| 1999 | 流域水資源與生態變遷之調查分析計畫—以後龍溪為案例(I) | 周昌弘; 洪楚璋; 吳俊宗; 邵廣昭 | 中央研究院報告,220 pp | |||
| 2002 | 淡水河口生態系統的建立 第三年報告集 | 邵廣昭; 李信徹; 馬堪津; 陳章波; 詹榮桂; 劉小如; 鄭明修; 謝蕙蓮; 吳俊宗; 邱志郁 | 台北 | |||
| 2001 | 淡水河本流及基隆河流域水中溶氧與河川底泥耗氧之調查及河川底泥處置之最適當及可行之方式規劃: 藻類與水質部份 | 吳俊宗 | EPA 034900112,2-1~2-17 | |||
| 2002 | 淡水河河口生態監測系統的建立 | 邵廣昭; 李信徹; 馬堪津; 陳章波; 詹榮桂; 劉小如; 鄭明修; 謝蕙蓮; 吳俊宗; 邱志郁 | 中央研究院,298pp |
