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1201503.知識饗宴系列11電子書李羅權; 陳錦地 ; 廖弘源; 李小媛; 吳金洌; 陳昭倫; 蔡宜芳; 楊建成; 陳仲玉 ; 沙培德 ; 張珣 台北市
2201402.知識饗宴「懸崖上的考古－八千歲『亮島人』出土的故事」陳仲玉 
32014Early Austronesian: Into and Out TaiwanAlbert Min-Shan Ko; Chung-Yu Chen ; Qiaomei Fu; Frederick Delfin; Mingkun Li; Hung-Lin Chiu; Mark Stoneking; Ying-Chin KoThe American Journal of Human Genetics 94：426-436
42013亮島人DNA研究陳仲玉 連江縣
52013馬祖亮島島尾遺址群發掘及『亮島人』修復計畫陳仲玉 ; 邱鴻霖; 游桂香; 尹意智; 林芳儀連江縣政府文化局
62013馬祖亮島島尾遺址群發掘及『亮島人』修復計畫陳仲玉 ; 邱鴻霖; 游桂香; 尹意智; 林芳儀連江縣
72012論海灣三角洲與海洋文明－以杭州灣三角洲為例陳仲玉 跨湖橋文化學術研討會論文集 (北京 : 文物出版社)
82012馬祖亮島島尾遺址第一期研究［期末報告］陳仲玉 ; 邱鴻霖; 游桂香; 尹意智; 林芳儀連江縣政府文化局
92012以考古學重建「馬祖列島」的歷史陳仲玉 文化馬祖（2011馬祖文化年鑑）(連江縣 : 連江縣政府文化局)
102012曲冰史前遺址群研究計畫成果報告趙金勇 ; 陳仲玉 ; 鍾亦興南投縣政府文化局, 132 p.
112011談馬祖列島的『曲蹄』族陳仲玉 2011馬祖研究：馬祖列島與海洋環境文化 (連江縣南竿鄉 : 連江縣政府)
122011談馬祖列島的「曲蹄」族陳仲玉 
132011古代馬祖列島的考古學考察陳仲玉 
142010馬祖列島的史前聚落陳仲玉 海洋遺產與考古，頁39-47 (科學出版社)
152010論臺灣高山地區的史前聚落陳仲玉 東南文化 2010.2，頁70-76
162010馬祖東莒島蔡園裡遺址的陶瓷陳仲玉 ; 游桂香福建文博 2010年第2期，頁1-5, 91
172010馬祖列島的史前聚落陳仲玉 
182010東沙群島經營管理的回顧與展望陳仲玉 國家公園學報 第20卷第1期，頁68-77
192009台灣高山地區的史前聚落陳仲玉 
202008馬祖東莒島蔡園裡遺址試掘陳仲玉 ; 王花俤
212008南中國海諸島上的碑碣陳仲玉 慶祝何炳棣先生九十華誕論文集，頁668-678 (西安 : 三秦出版社)
222007馬祖地區考古遺址田野調查與研究計畫陳仲玉 ; 王花俤等馬祖民俗文物館
232006東沙島的歷史與考古陳仲玉 
242006馬偕醫學院校地歷史古蹟監測報告陳仲玉 財團法人台灣基督長老教會馬偕紀念社會事業基金會
252005馬祖東莒熾坪隴史前遺址第二期研究報告陳仲玉 ; 王花俤等馬祖民俗文物館
262005略論島嶼史前考古學的基礎陳仲玉 
272005遠古時代的金門陳仲玉 金門文藝雙月刊 7：28-29
282005南海的歷史與考古陳仲玉 
292005金門史前時代的文化陳仲玉 金門歷史、文化與生態國際學術研討會論文集，頁1-19 (財團法人施合鄭民俗文化基金會)
302004談馬祖熾坪隴史前遺址的文化屬性陳仲玉 
312004臺閩地區考古遺址普查（七）－南投縣劉益昌; 陳仲玉 ; 郭素秋 內政部,500p.
322004馬祖東莒熾坪隴史前遺址的研究陳仲玉 ; 王花俤等馬祖民俗文物館
332004談馬祖熾坪隴史前遺址的文化屬性陳仲玉 
342004論臺灣高山地區的史前聚落陳仲玉 桃李成蹊集—慶祝安志敏先生八十壽辰，頁266-271 (香港 : 香港中文大學中國考古藝術研究中心)
352002試論台灣高山地區的史前遺址陳仲玉 
362002The Tatun She Site-A Last Ketagalan Villege on YangmingshanChung-Yu Chen 
372002試論中國東南沿海史前的海洋族群陳仲玉 考古與文物 2002.2，頁38-42
382002論中國考古學海洋島嶼的研究取向--以殷商文化的海洋成分為例陳仲玉 石璋如院士百歲祝壽論文集，頁209-225 (台北 : 南天書局)
392002泰南四府中國人的神廟與善堂陳仲玉 瓊粵地方文獻國際學術研討會論文集，頁347-364 (海口：海南大學出版社)
402002試論中國東南沿海的海洋族群陳仲玉 海峽兩岸河姆渡文化學術研討會論文集 (北京 : 海洋出版社)
412002石璋如先生訪問紀錄陳存恭; 陳仲玉 ; 任育德訪問; 任育德紀錄台北市 : 中央研究院近代史研究所
422001泰國的歷史與文化英文書目彙編 (A bibliography for the history and culture of Thailand)陳仲玉 Taipei
432001台灣原住民及其文化陳仲玉 
442001金門史前時代的文化陳仲玉 
452001台閩地區考古遺址普查研究計劃第六期研究報告陳仲玉 ; 劉益昌等內政部
462000集集共同引水計畫工區內共和遺址搶救發掘及鄰近地區施工監測報告陳仲玉 ; 劉益昌等經濟部水利處中區水資源工程局
472000Chinese Fisherman in the South China Sea to the Twentieth CenturyChung-Yu Chen 
482000南中國海諸島上的祠廟陳仲玉 中央研究院民族學研究所集刊 第89期(李亦園院士榮退特刊二)，頁275-295
492000泰國定都曼谷的海洋發展陳仲玉 
502000論海灣三角洲的考古學研究取向—以珠江三角洲為例陳仲玉 
512000吾土吾家－台灣的原住民陳仲玉 大自然 第67期，頁4-15
522000台灣考古學的回顧與前瞻陳仲玉 中國考古學跨世紀的回顧與前瞻：1999年西陵國際學術研討會論文集 (北京：科學出版社)
531999福建金門金龜山與浦邊史前遺址陳仲玉 東南考古研究 第二輯，頁52-61(廈門大學出版社)
541999Sea Nomads in Prehistory on the Southeast Coast of ChinaChung-Yu Chen 東南亞區域研究通訊 第7期，頁2-15
551999能丹國家公園設立可行性評估－人文史蹟部分陳仲玉 ; 趙金勇 內政部, 20 p.
561998陽明山國家公園大屯山區遺址之研究陳仲玉 陽明山國家公園管理處
571998論中國人向南海海域發展的四個階段陳仲玉 國立中央圖書館臺灣分館館刊 第4卷第4期，頁85-89
581998臺灣史前的玉器工業陳仲玉 東亞玉器—慶祝中國考古藝術研究中心創立二十周年論文集 Vol. I (香港中文大學中國考古藝術研究中心)，頁336-349
591998Sea Nomads in Prehistory on the Southeast Coast of ChinaChung-Yu Chen 
601998臺灣的「人」和文化－史前篇陳仲玉 大自然 第58期，頁20-27
611998近年來中國南海地區的考古工作陳仲玉 東南亞區域研究通訊 第4期，頁8-15
621998古代福州與琉球的海上交通陳仲玉 
631998史語所遷南港的第一倉庫陳仲玉 新學術之路：中央研究院歷史語言研究所七十周年紀念文集下冊，頁1009-1014 (台北 : 中央研究院歷史語言研究所)
641997福建省金門島考古遺址調查陳仲玉 國家公園學報 第7卷第1-2期，頁87-104
651997國家公園與歷史古蹟—以金門地區為例陳仲玉 
661997近百年間東沙島自然生態環境與人文景觀的變遷陳仲玉 ; 湯宗達國立中央圖書館臺灣分館館刊 第3卷第4期，頁85-95
671997東沙島與南沙太平島的考古學初步調查陳仲玉 中央研究院歷史語言研究所集刊 第68本第2分，頁449-502
681997金門島考古遺址調查研究陳仲玉 ; 董倫道; 黃信凱金門國家公園管理處
691997古代土城的居民陳仲玉 擺接風華土城情，頁1-5 (台北縣：土城市公所)
701996Prospects for Archaeological Research on the South China Sea RegionChung-Yu Chen 
711996中國南海地區考古學研究相關書目陳仲玉主編 台北
721996金門地區透地雷達探測貝塚陳仲玉 ; 董倫道第四屆科學史研討會彙刊，頁269-275 (台北：中央研究院科學史委員會)
731996中國南海區域考古學研究相關資料的四個範疇陳仲玉 海南暨南海學術研討會論文集，頁531-548 (台北：國立中央圖書館臺灣分館)
741996Prospects for Archaeological Research on the South China Sea RegionChung-Yu Chen SPAFA Journal 7(1), 35-42
751995環境影響評估中文化資產的調查與評估方法（下）陳仲玉 歷史文物月刊 第5卷第5期，頁130-133
761995中國南海區域考古學研究相關資料的四個範疇陳仲玉 
771995環境影響評估中文化資產的調查與評估方法（上）陳仲玉 歷史文物月刊 第5卷第4期，頁92-96
781995殷商骨柶上的裝飾藝術陳仲玉 中央研究院歷史語言研究所集刊 第66本第3分，頁813-919
791995金門地區考古遺址初步調查（一）陳仲玉 ; 董倫道內政部營建署
801995清代漢人拓殖埔里盆地與「眉番」所引起的族群變遷陳仲玉 第一屆臺灣本土文化學術研討會論文集，頁637-649 (台北：國立臺灣師範大學文學院、人文教育研究中心)
811995蘭嶼史前文化初探陳仲玉 慶祝建館八十周年論文集，頁667-715 (台北：國立中央圖書館臺灣分館)
821995東沙島南沙太平島考古學初步調查 (地政叢書第二十九輯)陳仲玉 內政部
831994關西機械科技專業區開發工程計劃文化遺址影響評估案陳仲玉 ; 陳維鈞 新環工程顧問股份有限公司
841994台閩地區考古遺址普查研究計劃第二期研究報告臧振華 ; 陳仲玉 ; 劉益昌內政部
851994曲冰 (中央研究院歷史語言研究所田野工作報告之二)陳仲玉 台北市
861994玉里長濱公路新建計劃環境影響說明書文化遺址調查評估工作（補充調查報告）陳仲玉 ; 陳維鈞 中央研究院歷史語言研究所
871994台北都會區大眾捷運系統土城延伸線文化遺址發掘及初步展示規劃陳仲玉 台北市政府捷運工程局
881994台灣與南海區域考古學相關研究的展望陳仲玉 兩岸及海外華人南海學術研討會論文集，頁49-54 (台北：中國國際法學會)
891993玉里長濱公路新建計劃環境影響說明書文化遺址調查評估工作陳仲玉 ; 陳維鈞 台灣省公路局
901993台閩地區考古遺址普查研究計劃第一期研究報告黃士強; 臧振華 ; 陳仲玉 ; 劉益昌內政部
911993私立青雲老人安養中心用地史蹟調查報告陳仲玉 私立青雲老人安養中心籌備處
921993曲冰遺址維護規劃案陳仲玉 南投縣政府
931993維護曲冰遺址的規劃理念陳仲玉 中國民族學通訊 第29期，頁25-29
941993敦煌莫高窟遺址近年的維護工作陳仲玉 科學史通訊 第12期，頁29-31
951992史前花蓮陳仲玉 大自然 第37期，頁58-63
961992A Prehistoric Settlement in the Mountains of Central Taiwan－and Discussion of the Origin of Mountainous SettlementsChung-Yu Chen 陳奇祿院士七秩榮慶論文集，頁451-463 (台北：陳奇祿院士七秩榮慶論文集編輯委員會)
971992台灣地區重要考古遺址初步評估第一階段研究報告宋文薰; 尹建中; 黃士強; 連照美; 臧振華 ; 陳仲玉 ; 劉益昌內政部
981991蓮花池史前遺址調查簡報陳仲玉 ; 楊淑玲國家公園學報 第2卷第3期，頁153-162
991991A Prehistoric Settlement in the Mountains of Central Taiwan─ and Discussion of the Origin of Mountainous SettlementsChung-Yu Chen 
1001991美國歷史古蹟維護政策陳仲玉 考古與歷史文化：慶祝高去尋先生八十大壽論文集(上)，頁277-309 (台北：正中書局)
1011990曲冰遺址的孢粉分析陳仲玉 ; 劉平妹田野考古 第1卷第1期，頁67-72
1021990布洛灣泰雅族文化展示館規劃陳仲玉 內政部營建署太魯閣國家公園管理處
1031989蘭嶼地理環境與生態景觀陳仲玉 大自然 9：24-25
1041989曲冰史前遺址—台灣一處高山古墟陳仲玉 歷史月刊 第21期，頁84-93
1051989待從頭收拾舊山河--沒落中的雅美文化陳仲玉 大自然 第9期，頁31-40
1061989立霧溪流域的考古學調查陳仲玉 中央研究院歷史語言研究所集刊 第60本第2分，頁215-287
1071989蘭嶼考古學初步調查陳仲玉 ; 楊淑玲; 高韻華內政部營建署
1081987陽明山國家公園人文史蹟調查陳仲玉等 內政部營建署陽明山國家公園管理處
1091986太魯閣國家公園人文史蹟調查陳仲玉 ; 邱敏勇; 楊淑玲台北市
1101986太魯閣國家公園人文史蹟調查陳仲玉等 內政部營建署太魯閣國家公園管理處委託
1111985曲冰遺址第一次發掘簡報陳仲玉 漢學研究 第3卷第1期，頁255-289
1121984美濃水庫計劃地區史蹟調查陳仲玉 財團法人中華顧問工程公司
1131984瑪家水庫計劃地區人文史蹟調查報告陳仲玉 ; 宋光宇; 劉益昌財團法人中華顧問工程司
1141984玉山國家公園預定地區人文史蹟調查陳仲玉 ; 曾振名台北市
1151984曲冰遺址第一次發掘報告陳仲玉 中央研究院歷史語言研究所集刊 第55本第2分，頁261-338
1161984八通關古道調查報告陳仲玉 中央研究院歷史語言研究所集刊 第55本第4分，頁791-823
1171983論中國的「中石器時代」陳仲玉 大陸雜誌 第67卷第5期，頁24-39
1181982玉山國家公園的人文景觀陳仲玉 科學月刊 第13卷第8期(總152期)，頁28-31
1191982玉山國家公園預定地區人文史蹟調查陳仲玉 ; 曾振名內政部營建署
1201982濁水溪上游河谷的考古學調查陳仲玉 中央研究院歷史語言研究所集刊 第53本第4分，頁711-745
1211981台灣的金箔製作工藝陳仲玉 大陸雜誌 第63卷第1期，頁16-32
1221980論「邦」與「國」陳仲玉 食貨月刊 第9卷第12期，頁1-9
1231979殷商裝飾藝術中的眼紋陳仲玉 東吳大學中國藝術史集刊 第9期，頁27-39
1241978論中國青銅器的起源陳仲玉 故宮季刊 12.4：11-21
1251977談「金石」與「篆刻」陳仲玉 中華民國篆刻學會年刊 1，頁26-38
1261975青銅匜形器的研究陳仲玉 東吳大學中國藝術史集刊 第4期，頁33-65
1271974記邾討鼎之一複器陳仲玉 國立歷史博物館館刊 第7期，頁31-32, 92
1281974青銅盉形器的研究陳仲玉 大陸雜誌 第48卷第4期，頁5-33
1291974先秦相官名號陳仲玉 臺灣師大歷史學報 第2期，頁247-260
1301972論宋代金石學之發達及其價值陳仲玉 食貨月刊 第2卷第9期，頁18-30
1311970「青銅病」的現象及其處理方法陳仲玉 大陸雜誌 第41卷第7期，頁1-9
1321969殷代骨器中的龍形圖案之分析陳仲玉 中央研究院歷史語言研究所集刊 第41本第3分，頁455-496